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通过使用悉尼研究人员开发的一种新的基因组测序技术,可以在4小时内发现新冠病毒感染源。
新州卫生病理研究所(NSW Health Pathology),加万医学研究所(Garvan Institute of Medical Research)和新南威尔士州大学的柯比学院(UNSW's Kirby Institute)的研究人员采用了一种最新的测序技术,以更快地追踪新冠病毒感染源。
上周,这种被称为纳米孔(Nanopore)的技术在一天之内确定隔离酒店的确诊清洁工感染的病毒是海外变异病毒。而在以前,需要两到三天的时间对病毒进行基因组测序。
“如果你想知道病毒的整个序列,你需要等待几天,但如果你只是想知道它与世界上其他病毒的联系,你可以在当天甚至几小时内知道结果。“ 新州卫生病理研究所的罗林森(Bill Rawlinson)教授表示。
罗林森教授说,通过该技术很快发现这名妇女可能不是在社区感染的病毒,这让接触追踪工作松了口气。
基因组测序是一个描绘病毒变化的过程,以确定它是在哪里获得的。
该技术被用于将悉尼西南部的十字路口酒店(Crossroads Hotel)疫情与维多利亚州的病例联系起来,并将阿德莱德最近的一系列病例与一名住在隔离酒店的英国归国旅客联系起来。
在周四发表在《自然通讯》(Nature Communications)上的一篇论文中,研究人员介绍了在新冠病毒追踪中使用该技术的分析验证和最佳实践指南。
用于纳米孔测序的仪器也只有智能手机那么大,而且只需一台笔记本电脑就可以使用,这为在医院进行测序提供了机会,而不是费尽周折将材料送到实验室。
纳米孔曾被研究人员用于应对西非的埃博拉疫情。
尽管以前的研究对该技术的准确性提出了质疑,但这项新的研究发现纳米孔在新冠病毒环境中具有很高的准确性。
罗林森教授表示,他认为这种方法不如“散弹枪”测序准确,但在新南威尔士州健康病理学的新冠病毒追踪和其他基因组测序中会有一席之地。
他预计这项技术将在诺富特酒店(Novotel)确诊病例这样的情况下最有用,因为需要快速而粗略地了解神秘病例的来源。
悉尼研究人员开发新技术 4小时可确认新冠感染源
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